schrodinger PyMOL 2.5.5 (x86/x64)
Platform: Windows® 7+ | System: x86 / 64-bit | Format: .rar /.exe | Größe: 505 MB | Sprache
: English | Hoster: NitroFlare /***File Rice
Molekulare Visualisierungsprogramme sind zu äußerst wertvollen Werkzeugen in vielen Bereichen der Wissenschaft geworden, einschließlich Computerchemie und Strukturbiologie. Sie ermöglichen es uns, die Struktur von Molekülen wie Proteinen, Nukleinsäuren und kleinen organischen Molekülen bis zu einem Detaillierungsgrad und einer kundenspezifischen Anpassung zu visualisieren und zu analysieren, die sonst in einem Labor nicht zu erreichen wären. Ab heute ist dies mit einem Computer möglich Tausende von Proteinstrukturen von speziellen Websites (z. B. Protein Data Bank (PDB)) herunterzuladen und Programme zu verwenden, um sie zu visualisieren, ihre Struktur zu drehen, auf die interessierenden Atome zu zoomen, Entfernungen zu berechnen, alles in wenigen einfachen Schritten. Diese Tools können helfen Wir verstehen die Beziehungen zwischen der Struktur und Funktion von Molekülen und können verwendet werden, um Medikamente zu entwerfen und zu optimieren, Protein-Ligand-Wechselwirkungen zu untersuchen und im Allgemeinen eine visuelle Darstellung von Proteinen und ihren wichtigsten strukturellen Merkmalen abzurufen. Einige der Vorteile der Verwendung von molekularer Visualisierung Software beinhaltet die allgemeine Fähigkeit, unser Verständnis der 3D-Struktur von Molekülen zu verbessern und somit die wesentlichen strukturellen Merkmale zu identifizieren l zum Funktionieren des Systems. Ein weiterer wichtiger Punkt ist die Möglichkeit, die dynamische Entwicklung des Systems zu beobachten, die durch Molecular Dynamics (MD)-Simulationen erhalten wird. Schließlich können sie nützlich sein, um qualitativ hochwertige Bilder und Filme für Ihre Veröffentlichungen oder Präsentationen zu erstellen. In diesem Tutorial werde ich die Grundlagen von PyMOL behandeln, einer der bekanntesten verfügbaren molekularen Visualisierungssoftware, damit Sie einen Vorgeschmack darauf bekommen können allgemeine Funktionsweise. Das Layout besteht hauptsächlich aus drei Komponenten. Wie der Name schon sagt, werden die Moleküle im Anzeigebereich angezeigt und manipuliert, sobald Sie sie in PyMOL laden. Standardmäßig können Sie drehen, zoomen und verschieben, indem Sie mit der Maus (linke Taste, rechte Taste bzw. Scrollrad) oder dem Trackpad (linke Taste, rechte Taste, Strg + Klick) ziehen.
